Pour gagner à Super Fly, il faut faire un carton en écrasant les bons insectes au bon moment. Au début de chaque tour, plusieurs cartes sont révélées. Quelqu’un compte alors « 1, 2, 3 ! » et tous les joueurs frappent en même temps la carte de leur choix avec leur tapette à mouches contenant un dé. Si un seul joueur frappe une carte, il la remporte. Si plusieurs joueurs frappent la même carte, celui dont le dé indique le nombre le plus élevé gagne la carte. Exception importante : si le nombre obtenu correspond exactement à celui inscrit sur la carte, l’insecte est éliminé et retiré de la partie. Les tours se poursuivent jusqu’à ce qu’un joueur ait collecté cinq cartes. On compare alors les collections pour déterminer laquelle est la plus grande selon un critère précis : même couleur, même nombre, ou au contraire toutes différentes en couleur et en nombre. Le joueur avec la meilleure collection remporte la manche et gagne un jeton chasseur de mouches. Les cartes sont ensuite mélangées pour démarrer une nouvelle manche. Le premier joueur à obtenir trois jetons chasseur de mouches remporte la partie.